한국정보과학회:학술대회논문집 (Proceedings of the Korean Information Science Society Conference)

한국정보과학회 (Korean Institute of Information Scientists and Engineers)
권호 표지

동역학 시스템의 진화적 학습에 의한 초파리 발생과정 모델링

Modeling Embryonic Development in Drosophila by Evolutionary Learning of Dynamical System

  • 이제근 (서울대학교 생물정보학 협동과정) ;
  • 남진우 (서울대학교 바이오정보기술연구센터) ;
  • 정제균 (서울대학교 생물정보학 협동과정) ;
  • 장병탁 (서울대학교 컴퓨터공학부)
  • Rhee Je-Keun (Graduate Program in Bioinformatics, Seoul National University) ;
  • Nam Jin-Wu (Center for Bioinformation Technology (CBIT), Seoul National University) ;
  • Joung Je-Gun (Graduate Program in Bioinformatics, Seoul National University) ;
  • Zhang Byoung-Tak (School of Computer Science and Engineering, Seoul National University)
  • 발행 : 2005.11.01
PDF 다운로드
⟨ 이전 논문 다음 논문 ⟩

초록

초파리 초기 발생과정은 gap 유전자, pair-rule 유전자, polarity 유전자의 세 가지 유전자 그룹에 의해서 조직화 된다. Gap 유전자들에 의해 pair-rules 유전자들의 발현이 조절되며, 이들에 의해 결국 polarity 유전자들의 발현을 조절함으로써, 정확한 위치에서 각 기관의 형성을 유도한다. 특히 분열 14단계에서는 pair-rule 유전자 중의 하나인 eve 유전자의 발현이 조절되는데, eve 유전자는 배아의 분할의 줄무늬를 형성시키는 유전자에 해당된다. 본 논문에서는 eve 유전자의 발현조절자인 hunchback, giant, kruppel, bicoid의 gap 유전자들로 구성된 조절 네트워크를 S-system을 이용하여 모델링하였다. 이를 통해 각 유전자들의 발현 데이터로부터 파라미터들을 진화 연산을 통해 예측하고, 각 유전자들의 발현에 대한 시뮬레이션 결과를 보여준다. 예측된 결과와 실제 데이터의 비교는 전체적으로 패턴이 서로 유사함을 보여주고 있다.

키워드