Design and implementation of a XQuery Expansion System using Bio-Ontology

생물학 온톨로지를 이용한 XQuery 확장 시스템 설계 및 구현

  • Kim Jeongjin (Division of Electronics and Information Engineering, National Chonbuk University) ;
  • Yang Kyungah (Division of Electronics and Information Engineering, National Chonbuk University) ;
  • Yang Jaedong (Division of Electronics and Information Engineering, National Chonbuk University) ;
  • Bae Myungnam (Electronics and Telecommunications Research Institute) ;
  • Chung Myunggeun (Electronics and Telecommunications Research Institute) ;
  • Lim Myungeun (Electronics and Telecommunications Research Institute)
  • Published : 2005.11.01

Abstract

본 논문에서는 온톨로지를 활용하여 생물학 데이터를 효율적으로 통합 검색하기 위한 XQuery일 확장 시스템을 설계하고 구현하였다. 이를 위해 본 논문에서는 먼저 공개 생물학 온톨로지 등인 GO, UMLS들로부터 의미 있는 정보를 추출하기 위한 생물학 온톨로지 API를 온톨로지별로 정의하였다. 정의된 온톨로지 API는 본 시스템에서 사용하는 XQuery의 사용자 정의 함수로써 포함되며 이 XQuery는 본 시스템에 내장된 XQuery Expander에 의해 확장되어 처리된다. 확장된 XQuery는 온톨로지를 이용함으로써 이질적인 구조와 용어로 이루어진 생물학 데이터들을 통합 검색 할 수 있으며, 온톨로지에 정의되어 있는 지식과 관계들을 확장검색에 활용함으로써 재현율을 획기적으로 높일 수 있다. 본 논문에서는 또한 XQuery의 작성을 용이하게 할 수 있도록 지원하는 GUI 환경도 구현하였다.

Keywords