Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)

  • 2005.07b
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  • Pages.280-282
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  • 2005
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  • 1598-5164(pISSN)
Korean Institute of Information Scientists and Engineers (한국정보과학회)
권호 표지

Pathway Reconstruction System using Orthlogs Database

Ortholog 데이터베이스를 이용한 생물 경로 재구축 시스템

  • Jung, Tae-Sung (Information Industrial Engineering, Chungbuk National University) ;
  • Oh, Jeong-Su (Management information Systems, Chungbuk National University) ;
  • Cho, Wan-Sup (Management information Systems, Chungbuk National University)
  • 정태성 (충북대학교 정보산업공학과) ;
  • 오정수 (충북대학교 경영정보학과) ;
  • 조완섭 (충북대학교 경영정보학과)
  • Published : 2005.07.01
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Abstract

현재 국내외 적으로 많은 대사경로 재구축을 위한 소프트웨어들이 개발 보급되고 있다. 그러나 기존의 소프트웨어들은 유전자 서열의 주해 작업이 끝난 게놈에 대해서만 가능하다. 따라서 대사경로를 예측하고자 할 경우는 주해 작업이 선행되어야 하는 어려움이 있었다. 본 논문에서는 주해 작업이 완료되지 않은 유전자 서열로부터 유전자의 기능 예측뿐만 아니라 대사경로를 예측할 수 있는 시스템을 제안한다. 제안된 시스템은 Orthologous 데이터베이스를 활용하여 새롭게 밝혀진 유전자 서열을 대상으로 비교적 정확성이 높은 대사경로를 예측하는 기능을 제공한다. 이 방법을 통해 주해 작업이 완료되지 않은 유전자 서열을 이용하여 서열 내에 포함된 유전자의 기능을 예측할 뿐만 아니라 예측된 유전자 정보를 이용하여 대사 경로를 예측할 수 있다.

Keywords