Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)

  • 2005.07b
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  • Pages.274-276
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  • 2005
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  • 1598-5164(pISSN)
Korean Institute of Information Scientists and Engineers (한국정보과학회)
권호 표지

Identification for Gene Regulatory Motifs by Kernel CCA

Kernel CCA를 이용한 유전자 발현 조절 기능 모티프 추출

  • Rhee Je-Keun (Graduate Program in Bioinformatics, Center for Bioinformation Technology, Seoul National University) ;
  • Joung Je-Gun (Graduate Program in Bioinformatics, Center for Bioinformation Technology, Seoul National University) ;
  • Chang Jeong-Ho (School of Computer Science and Engineering, Seoul National University) ;
  • Zhang Byoung-Tak (Graduate Program in Bioinformatics, Center for Bioinformation Technology, School of Computer Science and Engineering, Seoul National University)
  • 이제근 (서울대학교 생물정보학, 서울대학교 바이오정보기술 연구센터) ;
  • 정제균 (서울대학교 생물정보학, 서울대학교 바이오정보기술 연구센터) ;
  • 장정호 (서울대학교 컴퓨터공학부) ;
  • 장병탁 (서울대학교 생물정보학, 서울대학교 바이오정보기술 연구센터, 서울대학교 컴퓨터공학부)
  • Published : 2005.07.01
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Abstract

유전자 발현은 많은 전자조절인자에 의해서 조절된다. 이러한 조절인자들은 각각 DNA 상에 존재하는 특정한 모티프에 결합하여 그 기능을 수행한다. 따라서 DNA 상의 특정한 서열 정보가 유전자 발현과 직접적으로 연관되어 있다고 생각할 수 있다. 본 논문에서는 두 가지 서로 다른 데이터들에 대한 관계를 알아보기 위하여 사용되는 방법인 Kernel CCA를 이용하여 DNA 상의 특정한 모티프와 유전자 발현 사이의 관계를 알아보았다. 이를 이용한 실험 결과, 유전자 발현과 밀접하게 관련되어 있는 모티프들을 발견할 수 있었고, 기존에 중요한 것으로 알려져 있는 모티프가 실제로도 유전자 발현에 밀접한 영향을 미친다는 것을 알 수 있었다.

Keywords