Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)
- 2005.07b
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- Pages.262-264
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- 2005
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- 1598-5164(pISSN)
Estimation of Dinucleotide Step Parameters of Double Helix Structure on MicroRNA Using Genetic Algorithms
유전알고리즘을 이용한 MicroRNA 이중나선 구조의 Dinucleotide Step 파라미터 추정
- Nam Jin-Wu (Graduate Program in Bioinformatic Center for Bioinformation technology (CBIT)) ;
- Zhang Byoung-Tak (Graduate Program in Bioinformatic Center for Bioinformation technology (CBIT) Biointelligence Laboratory, School of Computer Science and Engineering Seoul National University)
- 남진우 (서울대학교 대학원 생물정보학, 서울대학교 바이오정보기술 연구센터(CBIT)) ;
- 장병탁 (서울대학교 대학원 생물정보학, 서울대학교 바이오정보기술 연구센터(CBIT), 서울대학교 컴퓨터 공학부 바이오지능 연구실)
- Published : 2005.07.01
Abstract
MicroRNA는 약 22 nucleotide 길이로, 세포질에서 유전자의 전사 후 조절 기능을 맡는 small RNA의 한 종류이다. MiRNA는 긴 전사체인 pri-miRNA에서 Drosha에 의해 절단 되어 핵 밖으로 나가 최종 Dicer에 의해 성숙된다. 하지만, 아직까지 이 효소들이 pri-miRNA를 잘라내는 3차 구조상의 메커니즘을 이해하지 못하고 있다. 본 연구에서는 완숙한 miRNA 이중나선이 약 2 회전을 이루게 된다는 정보를 바탕으로, Drosha가 붙는 miRNA stem구조의 dinucleotide step 파라미터를 유전 알고리즘을 이용하여 추정한다. 추정된 파라미터로부터 실제 miRNA들의 3차구조를 예측할 수 있으며, 3차 구조상의 Drosha의 절단 메커니즘을 이해하는데 도움을 줄 것이다.
Keywords