Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)
- 2005.07b
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- Pages.229-231
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- 2005
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- 1598-5164(pISSN)
A Domain based Parallel Prediction of Protein-protein interactions
도메인 기반 병렬 단백질 상호작용 예측
- Kim Chul-hwan (Dept. of Computer Eng, Hankuk Univ. of Foreign Studies) ;
- Chung Yoojin (Dept. of Computer Eng, Hankuk Univ. of Foreign Studies)
- Published : 2005.07.01
Abstract
본 논문에서는. 단백질은 도메인으로 모듈화 되어 있으며, 단백질 간 상호작용이 도메인간 상호작용의 결과라는데 착안, SVM을 이용하여 도메인 기반 단백질 상호작용을 예측하는 시스템을 구성하였다. 하지만, SVM 을 통한 실험은 정확한 예측 결과뿐 아니라 빠른 처리속도를 요구하게 되었다. 따라서 SVM을 병렬화하여 빠른 처리시간을 가지는 Parallel SVM을 적용, 도메인을 기반으로 한 단백질 상호작용을 실험하였으며, 이를 통해 정확성과 처리 속도를 측정, 비교함으로써 도메인 기반 병렬 단백질 상호작용 예측을 검증해 본다.
Keywords