GELIM: 유전자 네트워크 분석과 데이터 관리를 위한 통합 시스템

GELIM: An Integrated System with Genetic Network Analyzer and LIMS

  • Kim, Hye-Jung (Department of Computer Engineering, Pusan National University) ;
  • Cho, Hwan-Gue (Department of Computer Engineering, Pusan National University) ;
  • Park, Seon-Hee (Bioinformatics team, Electronics and Telecommunications Research Institute) ;
  • Shin, Mi-Young (Bioinformatics team, Electronics and Telecommunications Research Institute) ;
  • Jung, Ho-Youl (Bioinformatics team, Electronics and Telecommunications Research Institute) ;
  • Lee, Kyung-Shin (Department of Computer Engineering, Pusan National University)
  • 발행 : 2004.11.04

초록

생물학적으로 의미 있는 결과를 도출하기 위해서는 많은 실험 데이터가 필요하다. 최근에는 마이크로 어레이 실험 기술이 발달함에 따라 대량의 데이터를 얻을 수 있게 되었고, 이로 인해서 데이터를 체계적으로 관리하고 필요한 정보를 습득할 수 있는 시스템이 필요하게 되었다. LIMS(Laboratory Information Management System) 는 이러한 요구 조건을 충족시키기 위한 시스템으로 기존의 파일 시스템에 의존해서 비효율적으로 실험 데이터를 관리해 오던 것을 체계적이고 효율적으로 관리해 주기 위한 시스템이다. 대량의 유전자 발현 데이터의 생산은 유전자의 조절 네트워크 예측을 가능하게 하였다. 유전자간의 상호 작용을 분석하는 것은 세포의 활동을 이해하는데 매우 중요한 요소라고 할 수 있다. 본 논문에서는 기존의 LIMS 기능과 유전자 조절 네트워크 분석 시스템을 통합하여 사용자가 쉽게 데이터를 공유 및 습득할 수 있으며 편리한 사용자 인터페이스를 이용하여 컴퓨터에 익숙하지 않은 실험들도 쉽게 사용할 수 있는 GELIM(an Integrated system with GEnetic network analyzer and LIMs) 을 소개한다.

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