Ortholog protein finding System based on protein sequence and interaction information.

서열 및 상호작용 정보를 활용한 이종간 유사 기능 단백질 추출

  • 설영주 (세종대학교 컴퓨터공학과) ;
  • 김민경 (이화여자대학교 컴퓨터공학과) ;
  • 유성준 (세종대학교 컴퓨터공학과) ;
  • 박선희 (한국전자통신연구원)
  • Published : 2004.10.01

Abstract

단백질 간 상호작용은 생물체 내에서 발생하는 모든 생명 현상을 이루는 기본 단위로써, 이를 종 수준에서 밝히고자 하는 시도가 yeast와 초파리, Worm 등에서 보고되었다. 대량으로 존재하는 상호작용 데이터들은 종래에 서열로 시도되던 유연관계 비교 및 기능 유추 등에 기본 정보로 활용되고 있다. 본 연구에서는 다른 종에 속하는 동일 기능 단백질 즉, ortholog를 찾음에 있어, 기존의 서열 접근 방식 이외에 상호작용 정보론 추가로 사용하는 시스템을 고안하여 서열방식만을 활용하던 이전의 방식이 지니는 문제점을 극복하고자 하였다.

Keywords