ToMAS : 마이크로어레이 이미지 분석용 컴포넌트 도구

ToMAS : Component Tools for Microarray Image Analysis

  • 천봉경 (부산대학교 컴퓨터공학과, ALGORIGENE 연구실) ;
  • 장철진 (부산대학교 컴퓨터공학과, ALGORIGENE 연구) ;
  • 진희정 (부산대학교 컴퓨터공학과, ALGORIGENE 연구) ;
  • 이평준 (부산대학교 컴퓨터공학과, ALGORIGENE 연구) ;
  • 김혜정 (부산대학교 컴퓨터공학과, ALGORIGENE 연구) ;
  • 조환규 (부산대학교 컴퓨터공학과, ALGORIGENE 연구실)
  • 발행 : 2004.04.01

초록

마이크로어레이 칠을 이용한 실험은 한 번에 수백 혹은 수십만 개의 유전자 발현 정보나 유전자형을 얻을 수 있기 때문에 유전자 비교 분석에 있어서 획기적인 방법이라 할 수 있다. 정차 마이크로어레이 칩을 이용한 실험이 활발히 진행되면서 마이크로어레이 이미지 분석을 위한 소프트웨어가 필요로 하게 되었으며, 이를 위해 않은 소프트웨어들이 개발되었다. 하지만 지금까지 개발되어온 소프트웨어들은 필요한 기능을 하는 모듈을 재사용하여 소프트웨어를 쉽게 업데이트(update)하거나, 다른 소프트웨어 개발 시에 일부 필요한 모듈(module)들을 쉴게 재사용하기가 힘들었다 본 논문에서는 이러한 문제점을 극복하기 위해서 컴포넌트 기반으로 마이크로어레이 이미지 분석 소프트웨어 개발에 대해서 제안한다. 개발된 컴포넌트들은 사용자 편의에 맞게 새로운 마이크로어레이 이미지 분석 소프트웨어를 다시 개발하거나 단백질 침과 같은 다른 바이오 이미지 분석 소프트웨어 개발 시에서도 쉴게 재사용될 수 있어 개발기간 및 개발비용을 줄일 수 있다.

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