Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference (한국정보처리학회:학술대회논문집)

  • 2003.11b
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  • Pages.821-824
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  • 2003
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  • 2005-0011(pISSN)
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  • 2671-7298(eISSN)
Korea Information Processing Society (한국정보처리학회)
권호 표지

Division of ${\beta}-sheet$ for Protein Structure Comparison

단백질 구조 비교를 위한 ${\beta}-sheet$의 분할

  • Cho, Min-Su (School of Computer & Information Technology, Changwon National University) ;
  • Kim, Jin-Hong (School of Computer Engineering & Information Technology, University of Ulsan) ;
  • Lee, Myung-Joon (School of Computer Engineering & Information Technology, University of Ulsan) ;
  • Lee, Su-Hyun (School of Computer & Information Technology, Changwon National University)
  • 조민수 (창원대학교 컴퓨터.정보통신공학부) ;
  • 김진홍 (울산대학교 컴퓨터정보통신공학부) ;
  • 이명준 (울산대학교 컴퓨터정보통신공학부) ;
  • 이수현 (창원대학교 컴퓨터.정보통신공학부)
  • Published : 2003.11.14
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Abstract

단백질의 이차구조 중에서 ${\beta}-sheet$의 구조를 비교하는데 있어서 비정확성의 문제가 있다. 이는 ${\beta}-sheet$가 그 구조적 특성 때문에 휘어지기 때문이다. 그래서 본 논문에서는 PSA에서 정의된 ${\beta}-sheet$를 좀 더 적절하게 추상화하기 위해서 ${\beta}-sheet$를 분할하는 방법을 제안하였으며 이 방법을 DOM을 이용하여 JAVA로 구현하였다. 본 논문에서 제안한 방법은, 단백질의 이차구조의 정보를 포함하는 PSAML 데이터로부터 단백질의 구조 및 유사성을 비교하기 위한 단백질 구조비교 시스템에서 사용할 수 있다.

Keywords