Clustering of Gene Expression Data by using SOM and Hierarchical Clustering

자기 조직화 지도와 계층적 군집화를 이용한 유전자 발현 데이터 군집화 기법

  • 박창범 ((주)워치비젼 기술연구소) ;
  • 이동환 (고려대학교 정보통신대학 컴퓨터학과) ;
  • 이성환 (고려대학교 정보통신대학 컴퓨터학과)
  • Published : 2003.10.01

Abstract

본 논문에서는 유전자 발현 데이터를 분석하는데 있어서 자기 조직화 지도와 계층적 군집화 기법을 상호 보완적으로 사용하여 사용자가 보다 직관적으로 군집화 결과를 해석할 수 있는 방법을 제안한다. 제안된 방법을 사용하면 빠른 처리 속도로 대용량 데이터 처리에 적합한 자기 조직화 지도의 장점을 살릴 수 있으며 계층적 군집화의 장점인 가시화 기능을 이용하여 자기 조직화 지도의 단점인 군집 경계에 대한 불명확성을 해소하여 군집화 결과를 사용자가 쉽게 이해하고 직관적으로 해석할 수 있도록 도와준다. 본 논문에서 제안된 방법의 효용성을 검증하기 위해 세 종류의 데이터를 사용하여 실험을 수행한 결과 제안된 방법이 기존 방법에 비해 더 나은 성능을 보이는 것을 확인할 수 있었다.

Keywords