Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)

  • 2003.10b
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  • Pages.751-753
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  • 2003
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  • 1598-5164(pISSN)
Korean Institute of Information Scientists and Engineers (한국정보과학회)
권호 표지

The Improvement of RS3 System for Drug Substructure Searching

약물 부분 구조 검색을 위한 RS3 시스템의 개선

  • 이환구 (한양대학교 정보통신 대학원) ;
  • 차재혁 (한양대학교 정보통신 대학원)
  • Published : 2003.10.01
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Abstract

약물의 화학구조와 약리작용간의 관계는 'Medicinal Chemistry'에서 활발히 연구된다. 이에 도움이 되는 분야로 수많은 약물들에서 사용자가 지정한 구조를 부분구조로 가지는 약물들을 자동으로 빠르게 찾아내는 부분구조검색(Substructure Searching)이 있다. 1950년대부터 연구된 앞의 문제는 NP-Complete이나 미리 인덱스를 두어 성능을 높인 RS3 시스템(http://www.acelrys.com/rs3)이 미국 특허를 받았다. 이 시스템은 화학구조에 대한 설명을 대용량으로 기술하여 이를 RDBMS에 저장하고 검색하는 시스템이다. 하지만 이 시스템은 재현율(Recall)과 정도(Precision)가 매우 낮으므로, 본 논문에서는 새로운 인덱스를 개발하여 재현율과 정도를 향상시킨 기법을 제시한다.

Keywords