Proceedings of the Korea Society of Poultry Science Conference (한국가금학회:학술대회논문집)
- 2003.11a
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- Pages.67-68
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- 2003
Development of Expressed Sequence Tags(ESTs) from Korean Native Chicken cDNA Libraries
- Shin, Sang-Su (School of Agricultural Biotechnology, Seoul National University) ;
- Song, Ki-Duk (Avicore Biotechnology Institute) ;
- Shin, Jee-Hye (Avicore Biotechnology Institute) ;
- Lee, Sun-Duck (Avicore Biotechnology Institute) ;
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Lee, Young-Mok
(School of Agricultural Biotechnology, Seoul National University)
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- Kim, Jin-Kyu (Department of Microbiology, Chang Won National University) ;
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Han, Jae-Yong
(School of Agricultural Biotechnology, Seoul National University)
- Published : 2003.11.01
Abstract
한국 재래 닭의 유전적 특성 규명 및 기능 유전체 연구의 기초재료를 확보하고자 대량 EST 염기서열 결정 및 생물정보학 분석을 실시하였다. 대량 EST 염기서열 분석을 위한 첫 번째 단계로 재래 닭의 뇌, 비장, 정소, 배아 생식기를 이용하여 cDNA library를 구축하였다. 각각의 library로부터 총 15,121개의 클론을 선정하여 염기서열을 결정하였다. 생물정보학 분석결과 15,121개의 염기서열은 총 10,353개의 contig로 정리되었다. 이들 염기서열을 기존 데이터베이스를 대상으로 tBlastX(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST) 분석을 실시한 결과, 염기서열 중 56 ％가 기존 데이터베이스에 존재하는 유전자와의 상동성을 보였다. 상동성을 보이는 유전자들은 유전자의 구조 및 기능 분석에 이용될 것이고, 상동성을 보이지 않는 유전자들은 microarray와 같은 대량 유전자 발현분석 시스템을 이용하여 선별한 후 기능분석이 실시될 것이다.