Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)

  • 2003.04a
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  • Pages.890-892
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  • 2003
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  • 1598-5164(pISSN)
Korean Institute of Information Scientists and Engineers (한국정보과학회)
권호 표지

Calculation of Relation between Secondary Structures for Protein Structure Comparison

단백질 구조 비교를 위한 이차구조의 상관관계 계산

  • 조민수 (창원대학교 컴퓨터·정보통신공학부) ;
  • 안건태 (울산대학교 컴퓨터·정보통신공학부) ;
  • 이명준 (울산대학교 컴퓨터·정보통신공학부) ;
  • 이수현 (창원대학교 컴퓨터·정보통신공학부)
  • Published : 2003.04.01
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Abstract

단백질 구조의 표현 방법을 정형화하고 호환성 및 상호작용성을 향상하기 위하여 단백질의 이차구조 구성요소와 그들 사이의 관계를 이용하여 단백질 구조를 기술하는 PSA가 제안되었다. 본 논문에서는 PSA에서 정의된 단백질의 이차구조 사이에 정의된 요소 중에서 네 가지의 각도관계와 다섯 가지의 거리관계를 계산하는 방법에 대하여 기술하였으며, 이를 자바로 구현하여 그 결과를 확인하였다. 본 논문에서 제안한 방법은 단백질의 이차구조 사이의 상관관계를 포함하는 PSAML 데이터로부터 단백질의 구조 및 유사성을 비교하기 위한 단백질 구조비교 시스템에서 사용할 수 있다.

Keywords