HPV Risk Classification Using Kernel Based Learning

Kernel 기반 학습을 이용한 HPV의 위험군 분류

  • 정제균 (서울대학교 생물정보학 협동과정, 서울대학교 바이오정보기술 연구센터) ;
  • 오석준 (서울대학교 바이오정보기술 연구센터) ;
  • 장병탁 (서울대학교 생물정보학 협동과정, 서울대학교 바이오정보기술 연구센터, 서울대학교 컴퓨터공학부)
  • Published : 2003.04.01

Abstract

인유두종바이러스(human papillomavirus: HPV)는 감염되었을 때 각종 악성 종양을 유발할 수 있는 작은 DNA 바이러스이다. 고위험군에 속하는 HPV의 감염은 암으로 진행될 수 있는 가능성이 크다. 본 논문은 HPV를 분류할 수 있는 기계 학습 기법을 제안하고자 한다. 제안된 학습 기법은 단백질 서열을 효과적으로 분류할 수 있는 커널(kernel) 방법에 기반을 두고 있다. 위험군 분류는 감염의 메커니즘의 이해와 유전자칩과 같은 새로운 의학 도구의 개발 등에 있어서 중요한 정보를 제공해 줄 수 있다. 실험 결과는 중요한 부위의 탐색에 의한 커널 기반의 학습 방법이 우수한 성능을 보이는 것으로 나타났다.

Keywords