Automated Analysis of TDGS Image for SNP Discovery

SNP 발견을 위한 TDGS (Two-Dimensional Gene Scanning) 영상의 분석

  • Chang, Hwan (Dept. of Computer Engineering, Dankook University) ;
  • Park, You-Na (Dept. of Computer Engineering, Dankook University) ;
  • Lee, Bog-Ju (Dept. of Computer Engineering, Dankook University)
  • 장환 (단국대학교 전자컴퓨터공학과) ;
  • 박유나 (단국대학교 전자컴퓨터공학과) ;
  • 이복주 (단국대학교 전자컴퓨터공학과)
  • Published : 2003.04.01

Abstract

게놈 프로젝트에 의해 인간 유전자 영기서열이 밝혀지면서 개개인의 유전자에 나타나는 SNP(Single Nucleotide Polymorphism)을 분석하여 질병의 진단과 예후, 치료와 예방이 미래에 가능하게 되었다. 본 논문은 그러한 SNP 분석을 위한 자동 분석 시스템의 영상 처리 과정으로서, 기존의 육안을 통해 분석하였던 TDGS 영상을 본 시스템의 자동적인 영상 처리 과정을 통해 SNP 분석을 위한 디지털 패턴을 추출한다. SNP 분석을 위해 사용되는 샘플은 대략 수백개가 되는데, 실험이라는 특성상 영상에 나타나는 불규칙한 요소들이 많고. 영상의 상태가 좋지 않은 경우 명암도가 낮은 반점들의 구분이 힘들게 된다. 본 논문에서는 TDGS 영상의 지역적 특성을 가장 잘 반영하기 위한 동적 이진화의 새로운 척도를 제안하였고, 영상에서 잡영과 배경을 제거한 후 남겨진 관심영역을 반점으로 판별하여 이를 디지털 패턴으로 추출한 결과를 보여 준다.

Keywords