Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)

  • 2002.10c
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  • Pages.283-285
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  • 2002
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  • 1598-5164(pISSN)
Korean Institute of Information Scientists and Engineers (한국정보과학회)
권호 표지

Design and Implementation of 08MS-based Plant Mutant Proteome Analysis System

DBMS 기반 식물 돌연변이 단백질체 분석을 위한 시스템 설계 및 구현

  • 허정호 (포항공과대학교 생물학전문연구정보센터) ;
  • 박춘구 (포항공과대학교 생물학전문연구정보센터) ;
  • 박윤주 (포항공과대학교 생물학전문연구정보센터) ;
  • 최지인 (포항공과대학교 생물학전문연구정보센터) ;
  • 정동수 (포항공과대학교 생물학전문연구정보센터) ;
  • 남홍길 (포항공과대학교 생물학전문연구정보센터)
  • Published : 2002.10.01
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Abstract

생물학의 주된 목적이 세포 안에서의 유전자의 기능을 알아내는 것이므로 유전자의 실제 기능을 담당하는 단백질에 대한 연구는 필연적인 것이다. 근래에 이르러 2DE등의 실험방법 개선 둥으로 대량의 단백질에 대한 연구가 실현화됨에 따라, 프로트오믹스(proteomics)의 연구가 활성화되었으며, 본 실험팀 역시 식물 애기장대의 돌연변이들을 이용한 프로티오믹스 연구를 진행중이다. 프로티오믹스 연구는 실험 특성상 대량의 단백질 정보들을 얻게 되므로 데이터의 수작업 분석이 불가능하다. 그리하여 우리는 식물 애기장대(arabidopsis)의 특성과 2DE 실험에서 파생되는 여러 데이터들을 반영하여 정보를 효율적으로 관리할 수 있는 데이터 베이스를 설계 구축하였으며, 나아가 각 표현형을 대표할 수 있는 표지 단백질을 선별해내는 분석모듈을 구현하였다.

Keywords