Stand-Alone BLAST를 이용한 향상된 통합 서열분석시스템의 설계 및 구현

Design and Implementation of Advanced Sequence Analysis System using the Stand -Alone BLAST

  • 박춘구 (포항공과대학교 생물학전문연구정보센터) ;
  • 허정호 (포항공과대학교 생물학전문연구정보센터) ;
  • 최지인 (포항공과대학교 생물학전문연구정보센터) ;
  • 박윤주 (포항공과대학교 생물학전문연구정보센터) ;
  • 정동수 (포항공과대학교 생물학전문연구정보센터) ;
  • 남홍길 (포항공과대학교 생물학전문연구정보센터)
  • 발행 : 2002.10.01

초록

오늘날 급속하게 발전하는 유전자 분석기술은 유전자 서열(sequence), 단백질의 기능(function) 및 구조(structure)정보와 같은 생명현상의 연구에 필수적인 정보들을 제공하게 되었다. 특히, 인간 유전체 프로젝트의 완성 이후 염기 및 단백질의 서열데이터를 이용하여 유사한 서열데이터의 검색 및 관련 단백질의 기능, 구조 정보들과 같은 생물정보의 종합적인 검색이 요구되고 있다. 하지만 기존 대부분의 통합서열분석시스템들은 단지 관련 정보를 포함하는 데이터 베이스들에 접근하며 서열유사성을 분석한 후, 그 결과를 단순히 디스플레이 하는 것이 대부분 이였다. 부연하면, 기존 통합 서열분석시스템들은 각 데이터베이스로부터 검색된 결과들 간의 명확한 관계를 설명하지 못하여 종합적인 생물정보를 제공하지 못하고 있다. 따라서 본 논문에서는 염기 및 단백질의 서열데이터로부터 서열유사성 검색 및 관련 단백질의 기능, 구조정보에 해당하는 종합적 인 생물정보를 효과적으로 검색, 서비스 할 수 있는 통합 서열분석시스템의 설계, 구현에 관해 기술한다.

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