Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)

  • 2002.10d
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  • Pages.235-237
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  • 2002
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  • 1598-5164(pISSN)
Korean Institute of Information Scientists and Engineers (한국정보과학회)
권호 표지

Motif-Based Protein Clustering

Motif 기반의 단백질 군집화

  • Jin, Hoon (Department of Computer Science, Kyonggi University) ;
  • Kim, Hyun-Sik (Department of Computer Science, Kyonggi University) ;
  • Kim, In-Chul (Department of Computer Science, Kyonggi University)
  • 진훈 (경기대학교 전자계산학과) ;
  • 김현식 (경기대학교 전자계산학과) ;
  • 김인철 (경기대학교 전자계산학과)
  • Published : 2002.10.01
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Abstract

motif란 기능적으로 유사한 단백질 군의 아마노산 서열들에 공통적으로 나타나는 일정한 패턴이나 부분서열을 말한다. 본 논문에서는 motif들로 각 단백질의 특성을 표현한 다음, 이것을 기초로 유사성을 비교하여 단백질들을 기능적으로 유사한 여러개의 계층적 군으로 나누는 군집화 방법을 소개하였다. 영역 특성상 확장성과 계층성을 가지는 신경망 GHSOM을 군집화 알고리즘으로 사용하였고, 실제 307 개의 단백질들에 대한 군집화 실험을 통해 그 효과를 확인해보았다.

Keywords