Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)

  • 2001.04b
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  • Pages.181-183
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  • 2001
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  • 1598-5164(pISSN)
Korean Institute of Information Scientists and Engineers (한국정보과학회)
권호 표지

Development of a Tool for Building a 2-DE Database Based on the Federation of Proteome Libraries

프로테옴 라이브러리의 연합을 통한 이차원 전기영동데이터베이스 구축도구 개발

  • 박진수 (경상대학교 컴퓨터과학과) ;
  • 정채영 (경상대학교 컴퓨터과학과) ;
  • 김종준 (경상대학교 컴퓨터과학과) ;
  • 김재원 (경상대학교 미생물학과) ;
  • 이창원 (경상대학교 미생물학과) ;
  • 배종민 (경상대학교 컴퓨터과학과)
  • Published : 2001.04.01
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Abstract

인간 게놈프로젝트가 거의 완성되어 감에 따라서 해독된 유전자의 암호를 바탕으로 기능을 밝히는 연구가 많이 진행되고 있다. 그중에서 디스플레이 프로테오믹스에 관한 연구가 주목을 받으면서, 세계적으로 2-DE 데이터베이스가 많이 구축되었다. 이 데이터베이스를 구축하기 위해서는 자동화된 구축도구가 필요한데, 이 도구를 개발하기 위해서는 데이터베이스 통합이 필수적으로 요구된다. 본 논문에서는 생물학적 실험을 통하여 얻어진 펩티드 질량으로써, 다수의 펩티드 질량검색기를 통합하여 자동으로 단백질을 인식하고, 인식된 단백질에 대한 정보를 제공하는 다수의 프로테옴 관련 데이터베이스의 통합을 통해서 2-DE 데이터베이스를 자동으로 구축하는 도구와 데이터베이스 구축결과를 제시한다.

Keywords