Molecular Cloning and Nucleotide Sequence of Endo-Inulinase Gene from Xanthomonas oryzae #5

A 11.5-kb DNA fragment containing an endo-inulinase gene was cloned from Xanthomonas oryzae #5. It contained a single open reading frame of 3,999bp, encoding a polypeptide composed of signal peptide of 32 amino acids and mature protein of 1,301 amino acids. From the comparison of amino acids sequences with fructan hydrolases, inulinase, levanase and CFTase, the sequence of the endo-inulinase had highly homology of 72% with CFTase of B. circulans, and six highly conserved regions including the ${\beta}-fructosidase$ motif were found.

토양에서 분리한 endo-inulinase 생산 균주인 Xanthomonas oryzae #5로 부터 11.5kb의 endo-inulinase 유전자를 포함하는 재조합 plasmid를 함유한 형질 전환주를 분리하였다. 11.5kb의 단편으로부터 8.6kb, 4.1kb의 단편을 포함한 pDI 2, pDI4 재조합 plasmid를 제작하여 활성을 확인한 결과 endo-inuliase 활성을 나타내었으며, 재조합 plasmid pDI 2를 이용하여 DNA sequence를 한 결과 endo-inulinase 유전자는 1,333개의 아미노산으로 구성된 ORF를 가지고 있었다. 또한 B. circulans MCI-2554의 CFTase와 아미노산 배열에 있어은 약 72%의 높은 homology를 나타냈었으며, 다른 fructan hydrolases, inulinase, levanase와의 아미노산 비교로부터 ${\beta}-fructouranosidase$ motif를 포함한 6개의 유사부위를 확인하였다.